You're является сокращенной формой от you are.
Например:
You're welcome!
Пожалуйста!
That's why you're here.
Поэтому ты здесь.
Местоимение Your означает "принадлежащий тебе (вам)".
Например:
Don't count your chickens before they're hatched.
Цыплят по осени считают.
The trousers come in three different colours - just take your pick.
Эти брюки бывают трех разных цветов – просто сделайте выбор.